八十三年七月廿九日，海协会代表一行七人，由副秘书长孙亚夫率团搭机抵台，本会法律服务处处长林贵美前往接机。当日晚，许惠祐副秘书长与孙亚夫等举行工作晚餐，商定第五次事务商谈之议程及行程。
七月卅日上午，双方就「违反有关规定进入对方地区人员之遣返及相关问题」及「两岸劫机犯等遣返事宜」议题进行商谈。大陆方面对主动遣回问题提出五项条件，我方认为如此乃倒退作法，祇有主动遣回之名，而无主动遣回之实，表示无法接受。同日下午，商谈「两岸海上渔事纠纷之处理」，主要争点仍在纠纷调处之效力。
七月卅一日上午，商定第二阶段「焦唐会谈」之行程及议程。下午，商谈「两岸旅行安全及相关问题」及「两会联系有关事宜」；大陆方面执意将金、马驻军驱离大陆渔民越区捕渔之伤亡事件与旅行安全相提并论，并一再指责我方处理苏澳「上好三号」非法海上船屋不当。我方严词驳斥，以致商谈并无交集。同日上午，海协会来函，对孙亚夫一行于七月廿九日抵台时，在桃园中正国际机场遭我方少数民众推挤事，指称将严重影响商谈代表安全及尊严，并提及「不齿」、「不利」等强烈言词；而对海协会此一措辞严厉来函，本会当日即去函表示来函失实、失礼、失当，除深表遗憾外亦无法接受。
八月一日上午，商谈「违反有关规定进入对方地区人员之遣返及相关事宜」及「两岸劫机犯等遣返事宜」。双方逐条讨论立场之异同，以便进一步寻求突破。下午，亦以同一方式商谈「两岸海上渔事纠纷之处理」，就调处之效力，双方同意赋予强制执行力，但对实际运作方式仍有差距。
八月二日上午，商谈「两岸劫机犯等之遣返事宜」及「违反有关规定进入对方地区人员之遣返及相关事宜」。在「劫机犯之遣返」议题方面，主要症结仍在于「己方人民不遣返」及「准用条款」之问题；在「违反有关规定进入对方地区人员之遣返及相关问题」议题，大陆方面仍坚持就主动遣回附加多项条件，并坚持列入所谓虐待致伤残等赔偿问题；下午，续就「两岸海上渔事纠纷之处理」进行商谈。同日下午，海协会更就发生于本年七月十七日，为我方驻军驱离砲击伤亡之大陆渔民事件，来函指责我方金马驻军之驱离措施，并要求赔偿渔民损失，制裁肇事凶手。
八月三日休会一天。上午，孙亚夫一行由本会主任秘书吴恕陪同赴木栅参观观光茶园，并在张寅茶园品茗。下午，海协会常务副会长唐树备一行六人搭机抵台，本会副董事长兼秘书长焦仁和等亲往机场接机。晚间，焦仁和秘书长于台北世界贸易中心联谊社设宴欢迎唐树备先生一行。
八月四日上午，举行第一回合「焦唐会谈」，双方就三项议题、公证书查证、开办快捷邮件、文教科技交流、两岸遗产继承问题、经济交流、能源交流等进行大体讨论，并取得部份共识，并同意下午另设文教分组讨论。同日下午，双方就三项议题再进行商谈，我方表示有诚意签订协议，因协议涉及人民权利义务且须经立法院审议，务须考量我方基本立场，始能达成共识。大陆方面认为对议题之敏感争议点宜予模糊化，若太过明确，引致某些疑虑，将不可能签署协议。李庆平副秘书长则与海协会副秘书长刘刚奇先生，就两岸文教交流进行分组会谈，双方在青年交流、少年交流、文物交流、科技交流等方面获致多项共识。晚间，唐树备先生率同海协会三位副秘书长，到本会拜会辜董事长振甫；辜董事长并假西华饭店宴请唐树备一行。
八月五日上午，进行第二回合「焦唐会谈」，分别就公证书查证、开办快捷邮件、改善两岸通话品质、两会联系事宜、旅行安全等问题交换意见，对上述问题双方已取得部份共识；同时，李庆平副秘书长与海协会刘刚奇先生续就青少年交流、文物交流、科技交流等进行商谈，获致具体共识。当日下午，唐树备等一行，由李庆平副秘书长陪同往新竹科学园区参观联华电子、台阳通讯及宏碁电脑，园区管理局薛局长香川特设宴接待。同时，许惠祐副秘书长与刘刚奇先生则就遗产继承问题进行商谈，双方并获得初步共识，同意相互协助。
八月六日上午，进行第三回合「焦唐会谈」，双方先就文教、科技交流进行讨论，再就经济问题交换意见，双方就文物交流、科技交流及新闻交流等获致多项共识。下午，唐树备先生由本会秘书长焦仁和陪同拜会名誉董事长孙资政运璿。刘刚奇先生等一行则由本会文化服务处处长欧阳圣恩陪同参观国立故宫博物院。
八月七日上午及下午进行综合商谈，先就「两岸劫机犯等遣返事宜」议题中分歧较大的「己方人民不遣返」、「准用条款」及「一事不再理」等问题反复讨论，终获致突破性进展；并就「违反有关规定进入对方地区人员之遣返及相关问题」进行协商，对主动遣回、遣返费用等亦获致具体共识。晚间，海协会唐树备先生假福华饭店举行答宴，宴请本会董事长、董监事代表、谈判小组及工作人员等。
八月八日上午，海协会代表团一行十三人搭机离台。行前本会副董事长兼秘书长焦仁和先生与海协会常务副会长唐树备先生于中正机场贵宾室签署「海基会与海协会台北会谈共同新闻稿」。