海基会针对大陆方面违反协议，拒绝受理我方公（认）证书副本乙事，致函大陆福建、湖南、北京、上海、浙江、广西、山东、湖北、贵州及辽宁等地公证员协会，明确告知各该协会退回我方公（认）证书，已违反「两岸公证书使用查证协议」，严重影响两岸民众权益。

　　海基会在去函中特别强调，依照协议，双方相互寄送公证书副本以供核验，有关公证书的制作，则依双方各自之规定。目前我方公认证书所用钢印，海基会早于八十七年八月四日正式通报大陆有关单位，大陆方面从未表示意见，并已行之有年。为了保障两岸民众权益，共同维护两岸民间正常交流，海基会呼吁大陆方面尽速依协议回复正常运作。