有关10月13日晚间在大陆厦门大学就学的薛姓与廖姓两位台湾学生于餐厅用餐，遭该校教职员数人殴伤，送厦门中山医院接受医疗乙事，海基会于10月14日傍晚接获讯息后，第一时间即透过两岸两会紧急联系管道电话通报海协会并致函该会要求大陆方面：（1）给予两名受伤学生妥善医疗救助（2）严惩不法（3）查明真相（4）协助后续赔偿事宜。海基会表示，大陆海协会在接获通报后，已协调当地有关部门处理。海基会并于14日晚委托厦门台商协会代表本会前往医院探视两名学生，并致赠慰问金。
海基会对此事件表示遗憾，希望厦门大学能严惩肇事人员，由于台湾学生赴大陆就读大学不在少数，海基会同时呼吁学生在课业进修外，对于自身安全亦应小心注意。如发生急难事件，欢迎直接拨打海基会24小时紧急服务专线：02-27129292(自101年4月9日凌晨零时起，改为「02-25339995」)，海基会将有专人提供相关咨询与服务。