八十三年七月廿九日，海協會代表一行七人，由副秘書長孫亞夫率團搭機抵台，本會法律服務處處長林貴美前往接機。當日晚，許惠祐副秘書長與孫亞夫等舉行工作晚餐，商定第五次事務商談之議程及行程。
七月卅日上午，雙方就「違反有關規定進入對方地區人員之遣返及相關問題」及「兩岸劫機犯等遣返事宜」議題進行商談。大陸方面對主動遣回問題提出五項條件，我方認為如此乃倒退作法，祇有主動遣回之名，而無主動遣回之實，表示無法接受。同日下午，商談「兩岸海上漁事糾紛之處理」，主要爭點仍在糾紛調處之效力。
七月卅一日上午，商定第二階段「焦唐會談」之行程及議程。下午，商談「兩岸旅行安全及相關問題」及「兩會聯繫有關事宜」；大陸方面執意將金、馬駐軍驅離大陸漁民越區捕漁之傷亡事件與旅行安全相提並論，並一再指責我方處理蘇澳「上好三號」非法海上船屋不當。我方嚴詞駁斥，以致商談並無交集。同日上午，海協會來函，對孫亞夫一行於七月廿九日抵台時，在桃園中正國際機場遭我方少數民眾推擠事，指稱將嚴重影響商談代表安全及尊嚴，並提及「不齒」、「不利」等強烈言詞；而對海協會此一措辭嚴厲來函，本會當日即去函表示來函失實、失禮、失當，除深表遺憾外亦無法接受。
八月一日上午，商談「違反有關規定進入對方地區人員之遣返及相關事宜」及「兩岸劫機犯等遣返事宜」。雙方逐條討論立場之異同，以便進一步尋求突破。下午，亦以同一方式商談「兩岸海上漁事糾紛之處理」，就調處之效力，雙方同意賦予強制執行力，但對實際運作方式仍有差距。
八月二日上午，商談「兩岸劫機犯等之遣返事宜」及「違反有關規定進入對方地區人員之遣返及相關事宜」。在「劫機犯之遣返」議題方面，主要癥結仍在於「己方人民不遣返」及「準用條款」之問題；在「違反有關規定進入對方地區人員之遣返及相關問題」議題，大陸方面仍堅持就主動遣回附加多項條件，並堅持列入所謂虐待致傷殘等賠償問題；下午，續就「兩岸海上漁事糾紛之處理」進行商談。同日下午，海協會更就發生於本年七月十七日，為我方駐軍驅離砲擊傷亡之大陸漁民事件，來函指責我方金馬駐軍之驅離措施，並要求賠償漁民損失，制裁肇事兇手。
八月三日休會一天。上午，孫亞夫一行由本會主任秘書吳恕陪同赴木柵參觀觀光茶園，並在張寅茶園品茗。下午，海協會常務副會長唐樹備一行六人搭機抵台，本會副董事長兼秘書長焦仁和等親往機場接機。晚間，焦仁和秘書長於台北世界貿易中心聯誼社設宴歡迎唐樹備先生一行。
八月四日上午，舉行第一回合「焦唐會談」，雙方就三項議題、公證書查證、開辦快捷郵件、文教科技交流、兩岸遺產繼承問題、經濟交流、能源交流等進行大體討論，並取得部份共識，並同意下午另設文教分組討論。同日下午，雙方就三項議題再進行商談，我方表示有誠意簽訂協議，因協議涉及人民權利義務且須經立法院審議，務須考量我方基本立場，始能達成共識。大陸方面認為對議題之敏感爭議點宜予模糊化，若太過明確，引致某些疑慮，將不可能簽署協議。李慶平副秘書長則與海協會副秘書長劉剛奇先生，就兩岸文教交流進行分組會談，雙方在青年交流、少年交流、文物交流、科技交流等方面獲致多項共識。晚間，唐樹備先生率同海協會三位副秘書長，到本會拜會辜董事長振甫；辜董事長並假西華飯店宴請唐樹備一行。
八月五日上午，進行第二回合「焦唐會談」，分別就公證書查證、開辦快捷郵件、改善兩岸通話品質、兩會聯繫事宜、旅行安全等問題交換意見，對上述問題雙方已取得部份共識；同時，李慶平副秘書長與海協會劉剛奇先生續就青少年交流、文物交流、科技交流等進行商談，獲致具體共識。當日下午，唐樹備等一行，由李慶平副秘書長陪同往新竹科學園區參觀聯華電子、台陽通訊及宏碁電腦，園區管理局薛局長香川特設宴接待。同時，許惠祐副秘書長與劉剛奇先生則就遺產繼承問題進行商談，雙方並獲得初步共識，同意相互協助。
八月六日上午，進行第三回合「焦唐會談」，雙方先就文教、科技交流進行討論，再就經濟問題交換意見，雙方就文物交流、科技交流及新聞交流等獲致多項共識。下午，唐樹備先生由本會秘書長焦仁和陪同拜會名譽董事長孫資政運璿。劉剛奇先生等一行則由本會文化服務處處長歐陽聖恩陪同參觀國立故宮博物院。
八月七日上午及下午進行綜合商談，先就「兩岸劫機犯等遣返事宜」議題中分歧較大的「己方人民不遣返」、「準用條款」及「一事不再理」等問題反覆討論，終獲致突破性進展；並就「違反有關規定進入對方地區人員之遣返及相關問題」進行協商，對主動遣回、遣返費用等亦獲致具體共識。晚間，海協會唐樹備先生假福華飯店舉行答宴，宴請本會董事長、董監事代表、談判小組及工作人員等。
八月八日上午，海協會代表團一行十三人搭機離台。行前本會副董事長兼秘書長焦仁和先生與海協會常務副會長唐樹備先生於中正機場貴賓室簽署「海基會與海協會台北會談共同新聞稿」。