最近有媒體報導，有台商表示，近日海基會依兩岸人民關係條例第33條規定，密集邀請台商，針對國人在大陸黨政軍機構任職進行了解，全面清查台商在大陸涉黨政軍等相關職務。海基會鄭重澄清，相關臆測性報導內容均非事實，本會並未邀集台商清查台商在大陸涉黨政軍等相關職務，亦未邀集台商徵詢國人在大陸就職相關議題。
　　推展台商服務工作，維護兩岸人民及台商權益，進而維持兩岸關係的穩定發展，向來是海基會的重點工作。長年來，海基會與大陸各地台商協會保持密切聯繫與合作，共同維護台商人身安全與合法權益，已與大陸台商建立深厚的情誼。海基會相當了解台商在大陸創業的艱辛，不論兩岸關係如何發展，本會均一貫秉持加強對台商的聯繫與服務，持續做好台商的後盾。海基會也呼籲，國人在大陸經商或投資，務必遵守兩岸的法律規定，以保障自身權益。