針對今日蘋果日報有關「遭譏『漸涷人』，海基會『動』起來」的報導，海基會副董事長兼秘書長游盈隆指出，該報有關海基會的訊息是一篇嚴重污衊且悖離事實的報導，為了避免誤導社會大眾，他除了要表達強烈的抗議和不滿，也有必要作以下澄清﹕

一、自1999年以來，大陸方面即因政治因素片面中斷海基會與海協會聯繫管道，使兩會制度化協商與交流機制中斷，迄今未見恢復。兩岸政治關係雖多有起伏，但雙方的民間交流並未因此停歇，頻繁的交流現況也導引海基會逐步將會務發展及工作的重點，轉化為提升服務功能及品質。根據統計，海基會的服務案件數量由創會初期的5000餘件逐年增加，近年來甚至達到每年均超過30萬件的規模，除了台北之外，更先後在高雄、台中與花蓮成立服務處，充分反映民眾對海基會在提供服務方面的殷切需求。報導所稱「被政壇譏為『漸涷人』單位，每年處理的案例寥寥可數」，誠屬荒謬不實之陳述。

二、辜振甫先生在2005年辭世之後，海基會同仁在張俊雄董事長及洪奇昌董事長的領導下，各項業務穩定運作，除繳出了亮麗的成績單，並創造許多新猷，包括成立「台商服務中心」、「台商財經法律顧問團」、「律師志工團」、「兩岸人民急難服務中心」，開辦了「台商諮詢日」、「大陸配偶關懷專線」等，讓海基會的角色與功能能夠與時俱進，充分符合民眾的需求。海基會長期在兩岸之間發揮了無可取代之功能，批評海基會「處於『冬眠』狀態」的說法，如果不是出於對海基會業務的不了解，就是刻意扭曲事實，是不負責任的作法。

三、海基會係基於兩岸關係的獨特性而設立的機構，創會17年來，海基會同仁戮力以赴，充分發揮做為接受政府委託處理兩岸交流事務的中介團體所應擔負的功能與角色。媒體錯謬報導，不僅誤導視聽，更嚴重抹煞了海基會同仁的努力，對海基會全體同仁是一個傷害，也極不公平；對此，海基會表達強烈的抗議與不滿，並向各界澄清事實。（2008/4/15）