此次莫拉克颱風水災造成我方民眾生命與財產重大損失，大陸各界高度關注災情，數度表示願意提供物資與捐款協助我方救災與重建工作，海協會同時亦接受大陸各界捐款。由於重建工程已經展開，經雙方聯繫，海協會已於九月二十八日將第一批人民幣1.5億元之賑災款匯入本會專戶，本會於二十九日確定入帳。本會將就捐款使用項目與海協會再作溝通，並對大陸方面所展現的關懷與愛心，表達衷心謝忱。