兩岸經濟架構協議（ECFA）已於二○一○年六月二十九日完成簽署，兩岸經濟關係進入了新的里程碑。其中涉及農業部份，大陸提供十三個稅項（未含漁產品五稅項），八種農糧產品零關稅，加上原有提供十五種水果，十一種蔬菜，共有三十四種農產品銷往中國大陸免關稅。加上兩岸海空直航協議，不僅縮短運輸時間且降低運銷成本，二○一○年初簽訂之「兩岸農產品檢驗檢疫協議」，亦使台灣農產品銷往大陸更趨順暢。
台灣農產品外銷大陸佔有地利之便，ECFA簽訂後，如何落實零關稅優惠，使產業具體獲利外，如何將大陸建立成長期穩定外銷市場之一，更是今後努力的方向。
為積極布局國外市場，並兼顧國內消費需求，政府持續以「健康、效率、永續經營」為施政方針，制訂照顧消費者的食用安全，以企業化經營提高生產效率，並建立與生態環境共生的農業經營模式之農業政策，以因應當前總體環境情勢，輔導農民以現代化經營觀念，創造規模效益。

台灣農業輔導措施
（一）水果產業
台灣水果品質優良，惟因產業規模小且易受颱風等天然災害影響，致出口量僅佔年產量之一至二％。以往水果主要外銷目標市場以日本為主，隨著中國大陸經濟發展快速，人民所得及消費能力提高，加以兩岸直航，大幅縮短航程，水果到貨品質提高。近年台灣水果外銷大陸之數量快速增加，二○○九年水果外銷數量三○一五二公噸，其中一二二四九公噸外銷大陸及港澳地區，佔總外銷量之四十一％。在簽訂ECFA後，中國大陸在原已對我開放進口之二十二項水果中，將香蕉、柳橙、檸檬、紅龍果、哈蜜瓜等五項列入早收清單，自二○一一年起分二至三年降至零關稅，大陸已逐漸成為台灣水果之重要外銷市場。
經評估分析兩岸果樹產期及品質特色，台灣水果以鳳梨釋迦、鳳梨、葡萄柚及香蕉等較具外銷潛力。近三年（二○○六︱二○○九）輸銷大陸數量，分別為鳳梨釋迦由八十四公噸增加至二千六百八十九公噸，成長三千一百％；鳳梨由一百二十公噸增加至七百八十公噸，成長五百五十％；葡萄柚則維持七百五十︱一千公噸；另本（二○一○）年香蕉外銷大陸一千六百一十八公噸。
台灣水果之核心競爭力在「優質安全」，已普遍受國內外消費者肯定。近年中國大陸地區經濟發展迅速，對於果品安全及品質要求提高。「吉園圃」為目前外銷大陸水果之共同品牌，以利消費者選購參考，農委會已於二○○九年六月向大陸遞件申請吉園圃標章認證。
為強化外銷，政府已針對具市場潛力之品項，建置香蕉等十三項果品外銷供果園，辦理契作生產，建立外銷業者與供果園農民長期穩定之合作關係，以穩定貨源，並由技術服務團導入專家輔導系統，提升產品品質。自二○一一年起，外銷供果園需取得吉園圃安全蔬果標章者始予登錄，並完成外銷供果園簽核系統，新增「吉園圃」介接機制審查功能。
為落實「兩岸農產品檢驗檢疫協議」，政府選定「鳳梨」作為試辦實施便捷進口檢疫檢驗措施之品項，將於二○一一年二月間邀請陸方人員，實地訪察取得「吉園圃」標章之鳳梨供果園，給予相關便捷措施，再逐步適用至其他品項。
（二）花卉產業
台灣氣候適合文心蘭栽培，且育種栽培技術精進，花農年輕具創新研發能力，發展外銷產業深具優勢。為配合ECFA之實施，將加強輔導設置文心蘭外銷示範專區，輔導專區農戶與貿易商策略聯盟外銷，建立標準化作業流程與品質管理制度，各產區採併櫃方式銷往大陸，以開拓第二市場及分散出口市場風險。
文心蘭列入早收清單，讓文心蘭產業的成熟技術及穩定的供應品質，更具有市場潛力。二○○九年試銷中國大陸兩萬支，二○一○年預期可達三十︱五十萬支。雖然目前台灣產的文心蘭，在大陸售價每支約人民幣三︱四元，較大陸生產每支一．八元高出一倍，但只要將輸往日本出口量，找到適當之第二外銷市場，對於整體產業的產值即可達到改善效果。預期未來三年，輸往大陸之外銷量能達五百萬支，出口產值由三億元提昇至六億元新台幣的榮景。
為擴大產業規模，營造產業群落，除持續開發建設台灣蘭花生物科技園區，擴大設置蘭花外銷專區外，並配合相關政策性貸款，協助業者取得資金，以擴大生產規模。全區規劃面積一百七十五公頃，已完成園區一、二、三期，共計一百一十五公頃之土地開發，二十家業者進駐營運生產，溫室興建投資額約六億元，營業額約為四億元。蘭花外銷示範專區已累計設置文心蘭外銷示範專區六十四．一公頃，及國蘭外銷示範專區十五．一二公頃，協助廠商設施設備升級及營運改善，並推動文心蘭國際品質認證（ISO9001）及溫室栽培效益評估等業務。
（三）茶產業之輔導
台灣茶樹栽培面積約一萬五千公頃、總產量一．七萬公噸，台灣的文山包種茶、凍頂烏龍茶、阿里山高山茶及日月潭紅茶等早已享譽全球，尤其在大陸及日本甚受歡迎，二○○九年台灣茶葉出口中國大陸的數量約七百九十一公噸。因此，輔導成為精品名茶的數量將逐年提升，預計二○一○年供應一千兩百公噸，至二○一二年可供應兩千五百公噸以上，數量供應外銷大陸市場應無虞。
為建立台灣產之茶葉安全優質形象，政府持續輔導製茶廠及產銷班施行茶園共同防治、安全用藥及合理化施肥等健康管理，加強茶葉安全用藥監測，並輔導茶品完整標示，以符合食品衛生管理法相關規定。
二○一○年計輔導一百三十七個生產單位，參與廠農合作及茶園健康管理，面積達一千六百六十公頃，以供應內外銷市場需求。另輔導設立優質茶專區，規劃推動面積一百七十公頃，藉由「市場導向」輔導茶業產、製、銷合作經營，輔以「廠農合作」之基礎，延伸輔導體系至行銷業者，以穩定茶源供應品牌化茶品。
同時，為保障消費者權益，加強輔導茶葉生產單位申請產銷履歷驗證，並輔導主要茶區法人、團體或相關機關，向經濟部智慧財產局申請茶葉產地證明標章。目前嘉義縣政府、鹿谷鄉公所、台北縣市政府、竹山鎮公所及瑞穗鄉農會已分別取得「阿里山高山茶」、「鹿谷凍頂烏龍茶」、「文山包種茶」、「杉林溪茶」及「瑞穗天鶴茶」產地證明標章註冊，其中「阿里山高山茶」及「鹿谷凍頂烏龍茶」產地證明標章，截至九月已核發使用三十六萬餘枚，對於保障台灣產茶信譽及品質具有相當助益。

佈局大陸市場
二○○八年十二月兩岸海、空運直航後，開啟台灣生鮮農產品輸銷中國大陸新契機。二○○九年台灣生鮮水果出口至大陸外銷值達五百一十五．一萬美元，為二○○八年出口值之二．二倍，生鮮蔬菜出口大陸七十．九萬美元，為二○○八年出口值之七．八倍。本（二○一○）年一︱九月農產品銷往大陸出口值為十八萬三千六百八十一公噸、三億六千六百八十六萬美元，較上年同期成長二十三．八％、三十九．四％，其中生鮮水果部分，出口量值為七千六百九十三公噸、八百六十三．一萬美元，較二○○九年同期之四千零一十四公噸、三百七十六萬美元，大幅增加九十二％及一百三十％，顯現效益。
ECFA簽署後，陸方給予我方十八個免稅優惠項目，對台灣農產品銷中有實際助益。該十八個稅項，目前平均關稅為十三．三％，在協議生效後兩年內分階段降為零，以二○○九年大陸自台灣進口的金額估計，減稅金額可達兩百二十三萬美元。整體來說，未來減免關稅後，預估茶葉、文心蘭、金針菇等產品之出口競爭力可望提升，三年內出口值預計將由二○○九年的一十六百零八萬美元，大幅提高到一億一千萬美元。
農委會為協助業者拓展大陸市場，除辦理大陸市場調查外，並積極辦理各項參展行銷宣傳活動，包括輔導出口業者參加重要綜合食品展及專業展、在中國大陸重要消費城市與主要通路業者合辦「台灣蔬果節」、辦理CAS產品展售會、邀請大陸通路商來台參觀及貿易洽商、規劃於上海設置長期宣傳展售據點等。此外，為避免台灣農產品行銷大陸市場過程，遭到當地不肖業者仿冒競銷的威脅，農委會至大陸註冊「吉園圃台灣安全蔬果」、「CAS台灣優良農產品」等標章，並建立執法協處機制，以有效區隔市場。未來將以該標章即為台灣農產品「優質、安全、精品」之標識，在大陸平面及電子媒體、超市、百貨公司或量販店等通路，以及參加國際專業展、交易博覽會時，積極宣傳有這些標章者即為台灣生產之優質安全產品，俾與大陸產品區隔，以保障台灣農民的權益，並建立台灣農產品優質安全形象。
展望未來，台灣農產品將以安全、優質、免關稅之優勢，拓展大陸市場，更將在國際經濟舞台扮演重要角色。