馬總統在今年（二○一一）元旦文告中，首先以經國先生「今天不做，明天就會後悔」的名言，來點出馬政府推動兩岸關係發展的動機，將台海從過去的衝突熱點，變成今日的「和平大道」。馬總統以「百年和平」概念作為兩岸互動的主軸，首先重申「不統、不獨、不武」的現狀，以及以「九二共識，一中各表」為基礎與大陸協商，獲致兩岸關係的大幅度發展。他並強調「擱置爭議，爭取台海長期和平發展」是兩岸人民的共同願望，同時希望兩岸人民都能享有「自由、民主與法治的多元生活方式」。馬總統最後指出，兩岸不應該是政權、統獨、國際空間之爭，而應努力在「自由、民主、人權、法治等核心價值上彼此激勵，相互提升」，同時也強調關心大陸的人權發展是「珍視的核心價值」，是「測量與拉近兩岸距離的重要指標」。
馬總統元旦文告的兩岸關係論述，首先延續了二○○八年就職演說中「不統、不獨、不武」的基本原則，以及兩岸以「九二共識、一中各表」作為發展關係的基礎。對於兩岸是否存在「九二共識」的問題，國內的意見不一。事實上，雙方是否存在共識，重點在於雙方是否具有誠意與善意，在此基礎上發展關係。我們非常清楚，中國大陸不會放棄一個中國原則，我們也不會放棄一個中國就是中華民國，因此雙方都不會公開聲明接受對方的說法。但是，雙方都不挑戰彼此的說法，而願意在「九二共識」的創造性模糊情況下推展兩岸關係。也就是在此基礎下，兩岸兩會自二○○八年五月之後，進行了六次會談，簽署了十五項協議，達成一項共識。不僅營造了兩岸和緩的環境，受到國際社會的肯定，更為我們爭取到發展的空間與時間。
其次，今年的元旦文告結合了建國百年的時機，宣示在歷史以及文化方面，中華民國在台灣時期是與之前有著不可分割的延續性。而除了傳承之外，台灣還具有創新的能力，凡是到過台灣的大陸人士，對於台灣保有中華固有文化的程度與生活實踐都感到十分讚賞。更重要的是，台灣的經驗與成就，其實是中華文化儒家文明與資本主義的有效結合，這在中國歷史上是前所未有的經驗。台灣不但是中華文化的傳承地，也豐富了中華文化的內涵，它代表著以儒家文明為主體的社會，也能有效地發展出西方的民主與自由。
再次，今年元旦文告的最大特點是，著重強調了關注大陸民主與人權的情況，雖然歷年文告中也都曾提及，但今年則是特別加重。除了表示希望兩岸同享「自由、民主與法治的多元生活方式」，更是首次指出將關心大陸的人權發展視為是「核心價值」。哈佛大學教授奈伊（Joseph S. Nye, Jr.）二○一○年十二月在總統府的演講中，主張台灣要持續發展軟實力，繼續保有在人權、民主的成就，進而吸引中國大陸年輕人的關注。我們相信兩岸關係能夠在多元的環境中，藉著交往溝通、相互學習的過程，共同建構彼此可以接受的身份與文化，為兩岸人民謀求最大的福祉。
最後，元旦文告也對於質疑政府大陸政策的主張，做出了回應。對於批評政府「親中賣台」的國內在野陣營以及一些國外團體，馬總統以文告中對於「台灣民主」與「大陸人權」的主張，宣示我國擁有民主與人權的軟實力，重申政府堅持台灣民主精神與以民意為依歸。這是大陸政策的基本精神，也是台灣在與大陸往來時的「防護罩」，讓台灣不須畏懼與擔心兩岸互動。而對於疑慮台灣仍有可能從事台獨路線的聲音，文告則再點出「九二共識」原則，並強調兩岸非政權、統獨與國際空間之爭來做回應。
綜合觀察二○一一年的馬總統元旦文告，關於兩岸關係的論述，我們可以觀察到，暨秉持了「建國百年」的主軸，強調兩岸關係現狀的穩定性與延續性，也務實的以「民主」、「人權」訴求，來設定兩岸未來進行競爭的新議程，對於兩岸關係發展的現狀與未來的走向，提出了台灣自身的主張。