「九七」後台港間航運問題長久以來即受到兩岸三地高度關切。大陸海協會於八十六年三月致函本會，表示已獲授權並委任香港船東會趙世光等與我方指定團體交換意見。四月十二日陸委會正式授權本會處理，並指定張副秘書長為主談代表。經五月二日「香港會談」、及五月廿四日「台北會談」，雙方達成共識並簽署「台港海運商談記要」，並於六月十六日由本會與大陸海協會完成換文手續，七月一日生效，在期限內圓滿達成任務，讓「九七」後台港間航運順利航行。